Pedro,
   Vou ler com calma e comentar seu texto.
   Um abrcao,
   Miguel

   Olá Pedro,
   Vamos lá!
   vejamos suas duas opções:

   "Proposta 1:
   Elaborar um estudo multitemporal da produtividade 
   da cana no estado de São Paulo com base em indicadores 
   globais de autocorrelação espacial e indicadores locais 
   de associação espacial. Teria por finalidade verificar as 
   possíveis razões para as alterações de produtividade, 
   seja pela evolução e expansão da indústria canavieira, 
   seja pelo estágio de colheita (uma vez que a cana perde 
   em produtividade com o aumento do número de cortes),
   ou, seja por fatores ligados ao meio ambiente (precipitações."

   A pergunta aqui pedro é Qual é sua Hipótese, ous seja
   o que você acredita sejam as "razões para as alterações de produtividade"
   e como os Indicadores de Autocorrrelação entram nesta história?
   Eles deveriam ser usados para testar sua hipótese!
   Esta linha me parece interessante se voce tem os dardos e conhece
   o assunto. Você na verdade poderia avançar para um modelo
   explicativo utilizando regressão espacial e entender 
   que variávies participam nos processos 
   envolvendo a dinâmica da produtividade ( suas varições no espaó e no tempo)
   na área. Pode ser um belo trabalho, mas é necessário
   que de fato exista uma componente espacial importnate
   na composição da explicação do fenômeno.

   Sua segunda opcao agora.

    "Proposta 2: 
    Problema: Países da União Européia, Estados Unidos, alguns organismos 
    internacionais vêm dificultado os ideais do Brasil em transformar 
    a cana-de-açúcar em commodity. Uma das razões para isso é que 
    atualmente há uma discussão se a expansão da cultura canavieira 
    influencia no desmatamento na Amazônia. Há argumentos que o 
    desmate pode ser para o plantio da cultura ou que o seu avanço
    pelo estado de São Paulo pode estar diminuindo áreas de pastagem     
    e estas estejam se deslocando para a região amazônica."

   Minha questão aqui é: Qual é sua pergunta? O que 
   extamente você está tentando responder? E onde está o componente espacial
   entrando de FATO como uma categora analítica?
   Observar "transbordamento"que é o que voce desjaria, ouseja
   dado um cenário definido por uma politica de restriçao de 
   terra ( consumo de terra) para certa finalidade ( cana)
   o que vai acontecer com áreas nas "bordas"?
   O trabalho aqui envolve metodologias de modelagem dinamica espacialmente
   explicita e um OTIMO conhecimento dos
   processos para modelar e simular e observar os cenários
   que se se desenrolam a partior de suposições iniciais.
   isso se entendi de fato o problema que está muito aberto.

   Um abraco,

   Miguel