Recorte de layer no GIMP

O recorte deve ser definido manualmente.
Utilize as coordenadas do cursor para definir os limites do retângulo a ser preservado.
Calcule o numero de pixels em altura e largura.

No menu principal, use: Layer→ Boundary Size.
Preencha os campos de Altura (Height)e Largura (Width) em pixels.
Defina o Offset X como sendo a menor coordenadas X do retângulo, mas negativo (p.ex: -500).
Defina o Offset Y como sendo a menor coordenada Y do retângulo, mas negativo (p.ex: -100).
Clique em Resize.

No menu principal, use: Layer→ Autocrop Layer para aplicar em todos os layers.