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  Oi Gilson,
  assunto sempre bacana, atual e relevante.
  Como esta é uma área em que tenho trabalhado há anos queria apontar algumas questões e sugestões.
  Primeiro, certamente voce tem espaco e possibilidade de gerar um bom projeto de geoproc explorando a temática
  mas fique atento  eprocure fazer alguns recortes e nestes tentar estabelecer o tipod de INTEGRACAO e OPERCAO sobre
  as camadas de dados espaciais que voce fara. Voce tem dados ambientais (emgeral poligonais ou matriciais) , dados de cao (emgeral pontuais),
  dadops de mosquito ( que não sei como voce esta estabelecendo, etc.
  Em Taubaté tem a Profa Gisela Rita Alvarenga Monteiro Marques e o Dalton Fonseca que está finalizando sua dissertacao sobre dengue com orientacao da priimeora olhandp
  o estado de sao paulo coom um todo e varios anos!!
  Para os dados de taubaté observe que voce teria que trabalhar na escal intraurbana , e vai precisar de geodificacao, de uma nocao de bairros, de trablahar com setores censitários, etc.
  veja se voce tem estes dados em primeiro lugar.
  verifique em que hipoteses vai apostar.
  e por fim nao esqueca de considerar a capacidade do sistema de vigilancia e controle na equacao.
  Refine suas ideias e prossiga,
  abs
  Miguel
  Ps.: tenho um conjunto grande de trabalhos sobre Dengue, envolvendo, entomologia, epidemiologia, determinatntes socias e ambientais etc
  O ideal seria voce procurar um trabalho base e se orientar por ele para seu trabalho!