Pedro,
 Vou ler com calma e comentar seu texto.
 Um abrcao,
 Miguel

 Olá Pedro,
 Vamos lá!
 vejamos suas duas opções:

 "Proposta 1:
 Elaborar um estudo multitemporal da produtividade 
 da cana no estado de São Paulo com base em indicadores 
 globais de autocorrelação espacial e indicadores locais 
 de associação espacial. Teria por finalidade verificar as 
 possíveis razões para as alterações de produtividade, 
 seja pela evolução e expansão da indústria canavieira, 
 seja pelo estágio de colheita (uma vez que a cana perde 
 em produtividade com o aumento do número de cortes),
 ou, seja por fatores ligados ao meio ambiente (precipitações."

 A pergunta aqui pedro é Qual é sua Hipótese, ous seja
 o que você acredita sejam as "razões para as alterações de produtividade"
 e como os Indicadores de Autocorrrelação entram nesta história?
 Eles deveriam ser usados para testar sua hipótese!
 Esta linha me parece interessante se voce tem os dardos e conhece
 o assunto. Você na verdade poderia avançar para um modelo
 explicativo utilizando regressão espacial e entender 
 que variávies participam nos processos 
 envolvendo a dinâmica da produtividade ( suas varições no espaó e no tempo)
 na área. Pode ser um belo trabalho, mas é necessário
 que de fato exista uma componente espacial importnate
 na composição da explicação do fenômeno.

 Sua segunda opcao agora.

  "Proposta 2: 
  Problema: Países da União Européia, Estados Unidos, alguns organismos 
  internacionais vêm dificultado os ideais do Brasil em transformar 
  a cana-de-açúcar em commodity. Uma das razões para isso é que 
  atualmente há uma discussão se a expansão da cultura canavieira 
  influencia no desmatamento na Amazônia. Há argumentos que o 
  desmate pode ser para o plantio da cultura ou que o seu avanço
  pelo estado de São Paulo pode estar diminuindo áreas de pastagem     
  e estas estejam se deslocando para a região amazônica."

 Minha questão aqui é: Qual é sua pergunta? O que 
 extamente você está tentando responder? E onde está o componente espacial
 entrando de FATO como uma categora analítica?
 Observar "transbordamento"que é o que voce desjaria, ouseja
 dado um cenário definido por uma politica de restriçao de 
 terra ( consumo de terra) para certa finalidade ( cana)
 o que vai acontecer com áreas nas "bordas"?
 O trabalho aqui envolve metodologias de modelagem dinamica espacialmente
 explicita e um OTIMO conhecimento dos
 processos para modelar e simular e observar os cenários
 que se se desenrolam a partior de suposições iniciais.
 isso se entendi de fato o problema que está muito aberto.

 Um abraco,

 Miguel