Oi Gilson,
assunto sempre bacana, atual e relevante.
Como esta é uma área em que tenho trabalhado há anos queria apontar algumas questões e sugestões.
Primeiro, certamente voce tem espaco e possibilidade de gerar um bom projeto de geoproc explorando a temática
mas fique atento  eprocure fazer alguns recortes e nestes tentar estabelecer o tipod de INTEGRACAO e OPERCAO sobre
as camadas de dados espaciais que voce fara. Voce tem dados ambientais (emgeral poligonais ou matriciais) , dados de cao (emgeral pontuais),
dadops de mosquito ( que não sei como voce esta estabelecendo, etc.
Em Taubaté tem a Profa Gisela Rita Alvarenga Monteiro Marques e o Dalton Fonseca que está finalizando sua dissertacao sobre dengue com orientacao da priimeora olhandp
o estado de sao paulo coom um todo e varios anos!!
Para os dados de taubaté observe que voce teria que trabalhar na escal intraurbana , e vai precisar de geodificacao, de uma nocao de bairros, de trablahar com setores censitários, etc.
veja se voce tem estes dados em primeiro lugar.
verifique em que hipoteses vai apostar.
e por fim nao esqueca de considerar a capacidade do sistema de vigilancia e controle na equacao.
Refine suas ideias e prossiga,
abs
Miguel
Ps.: tenho um conjunto grande de trabalhos sobre Dengue, envolvendo, entomologia, epidemiologia, determinatntes socias e ambientais etc
O ideal seria voce procurar um trabalho base e se orientar por ele para seu trabalho!